Für ihr unermüdliches Wirken für Demokratie, Frieden und Toleranz wurde Inge Auerbacher vielfach geehrt. Unter anderem erhielt sie 1999 die Ellis Island Medal of Honour und den Louis E. Yavner Citizen Award.
2005 wurde ihr die Ehrendoktorwürde der Long Island University Brooklyn verliehen. Ihr Geburtsort Kippenheim lobte den Inge-Auerbacher-Preis aus, der an StudentInnen und Institutionen vergeben wird, die sich für Toleranz und Menschenrechte einsetzen.
2013 wurde sie mit dem Verdienstorden des Landes Baden-Württemberg und dem Verdienstorden der Bundesrepublik Deutschland ausgezeichnet.