בסוף חודש נובמבר 1941 החל הגירוש של יהודי וירטנבורג למחנות במזרח. אלזה ולדר גורשה לאיזביצה בפולין במהלך הגירוש השני בעשרים ושש באפריל  1942. המורה היהודי האחרון ארנולד אייזנברג יחד עם אשתו היו איתה באותו המשלוח.

הוריה של אלזה נותרו ברקסינגן.