במהלך ליל הבדולח נהרס בית הכנסת בהכינגן עד היסוד. לאון שמאלצבך נשלח למחנה הריכוז דכאו.

אחרי שחרורו ממחנה הריכוז ביקש לאון להגר לפראגווי. לצורך הגירתו הגיש בקשה לדרכון וקיבל אותו.

בנובמבר 1939 נעצר לאון שוב ונכלא בשטוטגרט, המאסר מנע ממנו לממש את תכנית ההגירה.